“神六”载人航天飞行获得圆满成功后，联合国发言人10 月17 日在新闻发布会上回答中国记者提问时表示，联合国秘书长安南对中国安全、成功完成第二次载人航天飞行表示最热烈的祝贺。安南认为，这次飞行又一次表明，对太空的探索没有国界，每一次圆满完成的和平利用太空的飞行，都是全人类在探索太空道路上迈出的重要一步。
        近几天来，不少友好国家常驻联合国代表和外交官向王光亚大使和中国代表团表示祝贺，称赞中国航天事业取得的成就。中国裁军大使胡小笛10 月12 日在纽约召开的第60 届联大第一委员会关于外空问题的发言中，专门提及中国成功发射“神六”，并强调，中国进行航天飞行科学试验，完全出于和平的目的，也是对人类科学与和平事业的贡献。中国愿与世界人民一道，为和平利用太空而携手共进。联大第四委员会本周将审议和平利用外层空间的国际合作问题，中国与会代表将进一步介绍包括成功发射“神六”在内的我国一年来在航天领域取得的成绩。
        驻维也纳联合国组织和各国代表也对中国实施“神舟”六号载人航天飞行给予广泛关注和高度评价，纷纷祝贺中国在载人航天方面取得的骄人成就。10月17 日，联合国毒品和犯罪问题办公室执行主任（兼主管包括外空业务在内的联合国驻维也纳办事处主任）科斯塔首先祝贺“神舟”六号圆满完成任务，称赞这是伟大中国取得的又一伟大成就。科并愉快地回忆起2 003 年他亲自将联合国旗帜移交中方并由“神舟”五号带入外空的情景，认为这一安排既体现了中国和平利用外空的崇高信念，也是对联合国工作的大力支持。科称联合国愿看到中国继续致力于和平探索、利用外空事业，愿与中国进一步加强合作。科建议双方可再次在维也纳共同举办航天展。
        联合国外空司司长卡马乔近日亦致函吴海龙大使，祝贺中国成功发射“神舟”六号载人飞船，表示“神舟”六号完成多人、多天飞行任务显示出中国具备整合多学科、多领域知识和技术的高超能力，在科技领域，特别是外空探索方面，取得了令人钦佩的成绩。来函还称，中国一直致力于和平探索利用外空，此次“神舟”六号圆满完成载人航天任务以及中国今后的载人航天计划必将开创和平利用外空国际合作的新纪元，并将造福于全人类，特别是广大发展中国家。另，外空司主管官员在向我团表示祝贺的同时，提出中方如能将此次载人航天飞行情况以书面形式提供给联合国外空司和广大会员国，将有利于加强国际外空合作的信息共享，也有利于宣传中国和平探索利用外空的政策和主张。
        此外，在此间参加《 联合国打击跨国有组织犯罪公约》 第二次缔约国会议的与会代表以及一些国家驻维也纳大使也纷纷祝贺“神舟”六号圆满完成载人航天任务。不少代表表示，中国近年来综合国力不断增强，“神舟”六号成功完成飞行再次表明，中国的强盛不仅体现在政治、经济领域，也体现在科学技术方面，期待着中国在国际事务中发挥更大作用。