航天员系统的主要任务可概括为“培养人、保障人、研究人”：一是“培养人”，建立一支适应空间站建设和运营的航天员队伍，为历次飞行任务选拔训练出合格的飞行乘组；二是“保障人”，建立适应航天特殊环境的医学保障技术、乘员支持技术和出舱活动保障技术，构建完善的在轨生活、工作和健康保障体系，同时通过医学工效学要求与评价确保航天器的适人性；三是“研究人”，研制航天医学在轨测量和实验平台，研究和掌握人在空间特性变化规律，开发先进生命支持技术，提高人在空间的工作效能。