载人飞船系统的主要任务是研制“神舟”号载人飞船。载人飞船采用轨道舱、返回舱和推进舱组成的三舱方案，额定乘员3人，可自主飞行7天。载人飞行结束后，其轨道舱继续留轨运行约半年，开展空间对地观测、科学与技术实验。